Beş yıl boyunca dile getirilmemiş duygular besleyen liseli Taiju Ooki, sonunda Yuzuriha Ogawa'ya aşkını itiraf etmeye hazırdır. Ancak Taiju tam itirafına başladığında, kör edici yeşil bir ışık Dünya'yı vurur ve dünyadaki tüm insanlığı taşlaştırarak her bir insanı taşa dönüştürür. Birkaç bin yıl sonra Taiju uyandığında modern dünyanın tamamen yok olduğunu görür, çünkü insanlığın hareketsiz kaldığı yıllarda doğa gelişmiştir. Heykellerden oluşan taştan bir dünyanın arasında Taiju yaşayan bir insanla daha karşılaşır: birkaç aydır aktif olan, bilimi seven arkadaşı Senkuu. Taiju, Senkuu'nun büyük bir plan geliştirdiğini öğrenir; uygarlığın bilimle tamamen yeniden canlanmasını başlatmak. Taiju'nun kas gücü ve Senkuu'nun zekâsı birleşerek müthiş bir ortaklık kurar ve kısa süre içinde taşlaşmış insanları canlandıracak bir yöntem keşfederler. Ancak Senkuu'nun ana planı, ideolojilerine uyananlar tarafından meydan okunduğunda tehdit altına girer. Tüm bunlar olurken, insanlığın taşlaşmasının nedeni bilinmemektedir.