Bir gün, parlak kırmızı güneş parlamayı bırakarak ''Çöküş Fenomeni ''ne neden olur - Arata Kasuga'nın kasabasının yıkımı ve orada yaşayan insanların ortadan kaybolması. Ancak her şey henüz kaybolmamıştır; çocukluk arkadaşı ve kuzeni Hijiri Kasuga tarafından kendisine verilen büyülü grimoire kullanılarak Arata'nın dünyası yapay olarak yeniden inşa edilir. Bu fenomeni araştırmak için Lilith Asami, yapay dünyası aniden parçalanan Arata'nın karşısına çıkar. Ona iki seçenek sunulur: kitabı teslim etmek ya da ölmek. Ancak Arata üçüncü seçeneği seçer ve çok gizli bir büyü okulu olan Royal Biblia Akademisi'ne kaydolur; burada kendisini altı büyü kullanıcısı daha beklemektedir. Lilith ile birlikte bu altı kişi, her biri kendi gücünü ve becerisini artıran okulun seçkinleri Trinity Seven'ı oluşturur. Hijiri'yi kurtarma hırsı ve yeni bulduğu arkadaşlarının yardımıyla Arata, sevgili memleketinin yok olmasını önlemek ve en iyi arkadaşını geri getirmek için hiçbir şeyden vazgeçmez.